多伦多大学团队使用AlphaFold获得对蛋白质结构的新见解
AlphaFold 蛋白质结构数据库包含数百万种蛋白质的预测结构。对于大多数含有本质无序区域 (IDR) 的人类蛋白质,这些区域不采用稳定的结构,通常认为这些区域具有较低的 AlphaFold2 置信度分数,反映了低置信度的结构预测。
AlphaFold 蛋白质结构数据库包含数百万种蛋白质的预测结构。对于大多数含有本质无序区域 (IDR) 的人类蛋白质,这些区域不采用稳定的结构,通常认为这些区域具有较低的 AlphaFold2 置信度分数,反映了低置信度的结构预测。
北京时间10月9日晚,国际知名学术期刊《自然-方法》(影响因子47.99)刊发了由复旦大学马剑鹏教授领衔的科研团队开发的新型计算方法OPUS-DSD。该算法不但能够成功地解析冷冻电子显微镜(Cryo-EM)结构解析技术中因传统方法无法分辨而缺损的生物大分子(比如蛋白质、核酸或蛋白质/核酸复合物等)结
在生物医学研究的前沿领域,“单细胞蛋白质组学”是怎样的存在?用一个比喻来说,它就像一把钥匙,能够开启细胞内部世界的大门,让我们得以窥见细胞如何通过蛋白质的相互作用来执行生命活动。
三十亿年的进化已经产生了极其多样化的蛋白质分子,但蛋白质的全部潜力可能要大得多。挖掘这种潜力对于计算和实验来说都是一个挑战,因为可能存在的蛋白质分子的空间,比那些可能具有功能的空间大得多。
·基础医学研究奖授予了谷歌DeepMind公司的科学家Demis Hassabis 和John Jumper;临床医学研究奖则授予了麻省理工学院的James G. Fujimoto教授和Eric A. Swanson先生以及俄勒冈健康与科学大学凯西眼科研究所的David Huang教授;医学科学特殊
在2000年出版的《剑桥世界食物史》(The Cambridge World History of Food)中,记载了一则轶事:1728年,意大利学者雅可布·贝卡利(Jacopo Beccari)宣布,发现白面粉中存在具有“动物物质”全部特性的东西。他的处理方式,是将和好的生面团在水中揉搓清洗,除
学位移分配对于基于核磁共振 (NMR) 的蛋白质结构、动力学和相互作用研究至关重要,可提供重要的原子级见解。然而,获得化学位移分配是劳动密集型的并且需要大量的测量时间。
作者 | 李梅、黄楠编辑 | 陈彩娴2018 年,Deepmind 首次发布基于深度神经网络的蛋白质结构预测数据库 AlphaFold,在蛋白质预测中实现了最先进的性能;去年,AlphaFold 2 获得了 98.5% 的蛋白质预测率;前段时间,Deepmind 又重磅发布了数据集更新,称目前的 A
信号肽 (SP) 对于跨膜和分泌蛋白靶向并将其转移到正确位置至关重要。许多现有的预测 SP 的计算工具忽视了极端的数据不平衡问题,而依赖于蛋白质的额外组信息。
蛋白质相互作用(PPI)可以说是人体最重要的分子事件之一,事关人体生长发育、新陈代谢,是疾病治疗干预的重要来源,PPI失调会导致癌症等疾病发生,因而该领域也是医药行业关注的研究热点。为了更好地预测和解读PPI,并深入挖掘相关分子信息,2023年3月,腾讯 AI Lab 联合香港科技大学、中国科学院大